**章導論 11研究背景 12研究現狀 121真菌侵染過程的研究 122真菌產生代謝物的研究 123侵染后的宿主防御研究 124相互作用的三級程度研究 125被侵染的昆蟲致死性行為變化研究 126昆蟲病原菌的傳播方式研究 127昆蟲宿主-病原菌模型的遺傳多樣性研究現狀 128昆蟲病原真菌的流行病學研究 129建模 1210控制潛力 1211毒力基因與非毒力基因 13研究技術路線 第二章基因功能的實驗研究過程 21載體結構 22質粒的擴大培養與提取（以天根質粒提取試劑盒為例） 23質粒酶切 24回收酶切質粒（OMEGA凝膠回收試劑盒） 25目的基因的尋找與電子PCR 26酶切位點分析 27引物設計和接頭添加 28PCR擴增 29上樣電泳 210PCR產物回收 211酶切質粒回收物和PCR純化產物的連接 212感受態大腸桿菌轉化 213陽性克隆鑒定 214靶基因的下游片段重組 215重組完整的質粒電轉到農桿菌 216農桿菌侵染目標真菌 217真菌轉化子培養與PCR驗證 2171真菌轉化子培養與PCR驗證過程 2172微量DNA提取試劑配方 218真菌轉化子的Southern Blotting雜交驗證 2181真菌基因組DNA提取 2182Southern Blotting雜交操作 第三章基因功能的生物信息學研究 31Motif的分析與再現 311序列下載 312Motif分析 313Motif分析再現 314MEME的應用 32Motif的批量分析方法 321文件準備 322導入數據與設置 323細節調整與文件保存 324空間位置大小調節 325文本設置 326其他 33多基因組比對和共線性分析Mauve軟件 34蛋白質三維結構預測（SWISS-MODEL） 35同源性分析—進化樹構建 351Mega軟件構建進化樹 352clustalx與Mega聯合構建進化樹 353在線比對與Mega聯合構建進化樹 354構建系統發育樹需要注意的問題 355系統發育樹的美化 36小RNA分析方法 361數據下載 362mRNA差異表達 363lncRNA差異表達 364miRNA差異表達 365ceRNA網絡構建 37基因編碼蛋白的二級結構預測 371PSIPRED Workbench在線預測 372COILS在線預測卷曲結構 373Jpred4在線預測 374scratchproteomics在線預測 375Predict Protein在線預測 376信號肽的在線預測 38蛋白質的物理化學性質預測 39基因的模體識別與解析 310蛋白結構的可視化 311基因的富集信號通路分析 312分子對接分析 3121分子對接的基礎 3122Chimera軟件分子對接過程 3123分子對接細節展示 3124分子對接結果平面化 313蛋白活性口袋的預測 314antiSMASH數據庫—微生物次生代謝物合成基因簇查詢和 預測 315蛋白的多級構比對分析 316Circos在線繪圖 第四章蝗綠僵菌微管蛋白（β-tubulin）基因的功能 41研究背景 42研究的內容 43實驗材料 431主要儀器設備 432主要試劑和培養基 44實驗方法 441菌株和培養條件 442生物信息學分析 443真菌基因組DNA和RNA提取 444熒光染色及觀察 445Southern blotting 446載體構建及轉化子的獲得 447孢子和蟲菌體的計數 448產孢量的測定 449昆蟲生測 4410PCR擴增程序和條件 4411數據處理 45結果分析 451蝗綠僵菌β-tubulin基因的生物信息學分析 452蝗綠僵菌目標基因β-tubulin基因敲除和回復轉化子的 驗證 453蝗綠僵菌β-tubulin基因對菌落形態和菌絲形態的 影響 454蝗綠僵菌β-tubulin基因對毒力的影響 455蝗綠僵菌β-tubulin基因對產孢的影響 456蝗綠僵菌β-tubulin基因對侵染結構附著胞的影響 457蝗綠僵菌β-tubulin基因在細胞核事件中的功能 46討論 第五章蝗綠僵菌MaPpt1負調控微循環產孢和紫外抗性 51研究背景 52研究內容和技術路線 521研究內容 522研究技術路線 53實驗材料 531主要儀器設備 532主要試劑和培養基 54實驗方法 541菌株和培養條件 542生物信息學分析 543真菌基因組DNA和RNA提取 544熒光染色及觀察 545Southern blotting 546載體構建及轉化子的獲得 547孢子和蟲菌體的計數 548產孢量的測定 549昆蟲生測 5410RNA的提取和定量分析 5411磷酸化蛋白質組學分析 5412數據處理 55結果分析 551蝗綠僵菌MaPpt1基因的生物信息學分析 552蝗綠僵菌MaPpt1目標基因的敲除和回復菌株的 構建 553蝗綠僵菌MaPpt1對菌落表型的影響 554蝗綠僵菌MaPpt1對產孢量的影響 555蝗綠僵菌MaPpt1對紫外逆境抗性的影響 556蝗綠僵菌中MaPpt1在濕熱逆境中的作用和表達模式的 分析 557MaPpt1在紫外和濕熱逆境中的作用 558蝗綠僵菌MaPpt1在不同培養基上對產孢的影響 559蝗綠僵菌MaPpt1對毒力的影響 5510蝗綠僵菌MaPpt1調控的信號途徑材料的選擇及RNA 質量評估 5511蝗綠僵菌MaPpt1 基因的敲除改變了產孢的信號 途徑 5512蛋白質組學分析MaPpt1在產孢和UV抗性的作用 機制 5513MaPpt1調控的基因網絡 56討論 第六章主要結論與展望 附錄 AqRT-PCR數字表達譜驗證結果 B蛋白質組學分析結果 C蛋白質組學質譜圖 D縮略詞 E常用色素配制及使用方法 F常用抗生素配制及使用方法 G常用培養基 H常用試劑配制方法 I常用酸堿指示劑及變化范圍 J常用生物鑒定引物